No Departamento de Física da PUC-Rio o ensino de pós-graduação stricto sensu (mestrado e doutorado) é gratuito. O Departamento conta com apoio de bolsas de estudo de vários órgãos de fomento. As agências financiadoras de pesquisa e formação de recursos humanos que oferecem bolsas de estudos aos alunos de Pós-Graduação matriculados no mestrado e doutorado são: CAPES, CNPq, FAPERJ e a mesma PUC-Rio.
Mesmo para os alunos com vínculo empregatício que não possam receber bolsas das agências de fomento a PUC-Rio oferece a isenção integral da mensalidade.
À Comissão de Programa da Pós-Graduação compete a seleção, a concessão de bolsas e o acompanhamento de todos os bolsistas.